Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP1Q04837 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms