Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TOP2BQ02880 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms