Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms