Protein–RNA interactions for Protein: Q00973

B4GALNT1, Beta-1,4 N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT1Q00973 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
B4GALNT1Q00973 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
B4GALNT1Q00973 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms