Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms