Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUCB2P80303 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUCB2P80303 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms