Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PITX1P78337 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PITX1P78337 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PITX1P78337 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PITX1P78337 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PITX1P78337 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PITX1P78337 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PITX1P78337 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PITX1P78337 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PITX1P78337 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PITX1P78337 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PITX1P78337 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PITX1P78337 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PITX1P78337 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PITX1P78337 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PITX1P78337 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PITX1P78337 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITX1P78337 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITX1P78337 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITX1P78337 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITX1P78337 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITX1P78337 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITX1P78337 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITX1P78337 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITX1P78337 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITX1P78337 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITX1P78337 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITX1P78337 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITX1P78337 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITX1P78337 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PITX1P78337 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITX1P78337 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PITX1P78337 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITX1P78337 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITX1P78337 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITX1P78337 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITX1P78337 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITX1P78337 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PITX1P78337 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PITX1P78337 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PITX1P78337 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PITX1P78337 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PITX1P78337 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PITX1P78337 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PITX1P78337 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PITX1P78337 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PITX1P78337 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PITX1P78337 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PITX1P78337 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PITX1P78337 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PITX1P78337 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PITX1P78337 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PITX1P78337 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PITX1P78337 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PITX1P78337 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PITX1P78337 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PITX1P78337 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PITX1P78337 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PITX1P78337 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PITX1P78337 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PITX1P78337 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PITX1P78337 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PITX1P78337 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PITX1P78337 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PITX1P78337 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PITX1P78337 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PITX1P78337 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PITX1P78337 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PITX1P78337 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PITX1P78337 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PITX1P78337 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PITX1P78337 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PITX1P78337 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PITX1P78337 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PITX1P78337 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PITX1P78337 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PITX1P78337 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PITX1P78337 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PITX1P78337 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PITX1P78337 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PITX1P78337 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PITX1P78337 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PITX1P78337 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PITX1P78337 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PITX1P78337 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PITX1P78337 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PITX1P78337 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PITX1P78337 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PITX1P78337 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PITX1P78337 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PITX1P78337 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PITX1P78337 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PITX1P78337 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PITX1P78337 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PITX1P78337 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PITX1P78337 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PITX1P78337 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PITX1P78337 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PITX1P78337 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PITX1P78337 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms