Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2P78314 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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