Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVS71-1P61550 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms