Protein–RNA interactions for Protein: P61163

ACTR1A, Alpha-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1AP61163 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACTR1AP61163 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR1AP61163 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms