Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CABP4P57796 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CABP4P57796 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CABP4P57796 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CABP4P57796 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CABP4P57796 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CABP4P57796 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CABP4P57796 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CABP4P57796 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CABP4P57796 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CABP4P57796 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CABP4P57796 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CABP4P57796 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CABP4P57796 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CABP4P57796 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CABP4P57796 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CABP4P57796 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CABP4P57796 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CABP4P57796 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CABP4P57796 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CABP4P57796 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CABP4P57796 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CABP4P57796 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CABP4P57796 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CABP4P57796 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CABP4P57796 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CABP4P57796 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CABP4P57796 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CABP4P57796 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CABP4P57796 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CABP4P57796 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CABP4P57796 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CABP4P57796 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CABP4P57796 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CABP4P57796 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CABP4P57796 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CABP4P57796 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CABP4P57796 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CABP4P57796 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CABP4P57796 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CABP4P57796 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CABP4P57796 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CABP4P57796 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CABP4P57796 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CABP4P57796 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CABP4P57796 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CABP4P57796 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CABP4P57796 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CABP4P57796 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CABP4P57796 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CABP4P57796 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CABP4P57796 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CABP4P57796 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CABP4P57796 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CABP4P57796 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CABP4P57796 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CABP4P57796 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CABP4P57796 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CABP4P57796 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CABP4P57796 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CABP4P57796 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CABP4P57796 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CABP4P57796 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CABP4P57796 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CABP4P57796 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CABP4P57796 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CABP4P57796 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CABP4P57796 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CABP4P57796 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CABP4P57796 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CABP4P57796 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CABP4P57796 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CABP4P57796 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CABP4P57796 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CABP4P57796 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CABP4P57796 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CABP4P57796 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CABP4P57796 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CABP4P57796 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CABP4P57796 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CABP4P57796 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CABP4P57796 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CABP4P57796 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CABP4P57796 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CABP4P57796 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CABP4P57796 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CABP4P57796 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CABP4P57796 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CABP4P57796 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CABP4P57796 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CABP4P57796 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CABP4P57796 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CABP4P57796 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CABP4P57796 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CABP4P57796 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CABP4P57796 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CABP4P57796 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CABP4P57796 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CABP4P57796 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CABP4P57796 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms