Protein–RNA interactions for Protein: P57060

RWDD2B, RWD domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD2BP57060 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RWDD2BP57060 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RWDD2BP57060 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms