Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHB3P54753 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHB3P54753 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms