Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRAP54198 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRAP54198 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRAP54198 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIRAP54198 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRAP54198 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRAP54198 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRAP54198 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRAP54198 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRAP54198 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRAP54198 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRAP54198 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRAP54198 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRAP54198 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRAP54198 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRAP54198 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRAP54198 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRAP54198 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRAP54198 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRAP54198 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRAP54198 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRAP54198 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRAP54198 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIRAP54198 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIRAP54198 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIRAP54198 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIRAP54198 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIRAP54198 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIRAP54198 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIRAP54198 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIRAP54198 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIRAP54198 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HIRAP54198 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIRAP54198 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIRAP54198 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIRAP54198 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIRAP54198 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIRAP54198 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIRAP54198 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIRAP54198 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIRAP54198 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIRAP54198 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIRAP54198 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIRAP54198 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIRAP54198 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HIRAP54198 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIRAP54198 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIRAP54198 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIRAP54198 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIRAP54198 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIRAP54198 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIRAP54198 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIRAP54198 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIRAP54198 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIRAP54198 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIRAP54198 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIRAP54198 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIRAP54198 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIRAP54198 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIRAP54198 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIRAP54198 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIRAP54198 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIRAP54198 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIRAP54198 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIRAP54198 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIRAP54198 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIRAP54198 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIRAP54198 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HIRAP54198 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HIRAP54198 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HIRAP54198 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HIRAP54198 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HIRAP54198 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIRAP54198 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIRAP54198 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIRAP54198 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIRAP54198 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIRAP54198 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIRAP54198 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIRAP54198 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIRAP54198 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIRAP54198 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIRAP54198 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIRAP54198 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIRAP54198 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIRAP54198 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIRAP54198 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIRAP54198 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIRAP54198 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIRAP54198 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIRAP54198 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIRAP54198 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIRAP54198 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIRAP54198 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIRAP54198 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIRAP54198 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIRAP54198 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIRAP54198 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIRAP54198 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIRAP54198 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms