Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms