Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DAP3P51398 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DAP3P51398 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DAP3P51398 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DAP3P51398 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DAP3P51398 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DAP3P51398 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DAP3P51398 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DAP3P51398 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DAP3P51398 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DAP3P51398 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DAP3P51398 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DAP3P51398 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DAP3P51398 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DAP3P51398 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DAP3P51398 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DAP3P51398 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DAP3P51398 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DAP3P51398 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DAP3P51398 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DAP3P51398 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DAP3P51398 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DAP3P51398 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DAP3P51398 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DAP3P51398 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DAP3P51398 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DAP3P51398 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DAP3P51398 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DAP3P51398 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DAP3P51398 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DAP3P51398 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DAP3P51398 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DAP3P51398 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DAP3P51398 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DAP3P51398 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DAP3P51398 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DAP3P51398 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DAP3P51398 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DAP3P51398 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DAP3P51398 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DAP3P51398 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DAP3P51398 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DAP3P51398 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DAP3P51398 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DAP3P51398 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DAP3P51398 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DAP3P51398 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DAP3P51398 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DAP3P51398 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DAP3P51398 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DAP3P51398 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DAP3P51398 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DAP3P51398 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DAP3P51398 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DAP3P51398 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DAP3P51398 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DAP3P51398 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DAP3P51398 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DAP3P51398 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DAP3P51398 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DAP3P51398 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DAP3P51398 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DAP3P51398 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DAP3P51398 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DAP3P51398 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DAP3P51398 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DAP3P51398 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DAP3P51398 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DAP3P51398 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DAP3P51398 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DAP3P51398 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DAP3P51398 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DAP3P51398 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DAP3P51398 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DAP3P51398 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DAP3P51398 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DAP3P51398 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DAP3P51398 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DAP3P51398 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DAP3P51398 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DAP3P51398 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DAP3P51398 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DAP3P51398 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DAP3P51398 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DAP3P51398 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DAP3P51398 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DAP3P51398 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DAP3P51398 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DAP3P51398 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DAP3P51398 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DAP3P51398 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DAP3P51398 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DAP3P51398 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DAP3P51398 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DAP3P51398 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DAP3P51398 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DAP3P51398 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DAP3P51398 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DAP3P51398 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DAP3P51398 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms