Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATMP50440 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATMP50440 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATMP50440 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATMP50440 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATMP50440 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATMP50440 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATMP50440 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATMP50440 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATMP50440 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATMP50440 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATMP50440 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATMP50440 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GATMP50440 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATMP50440 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATMP50440 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATMP50440 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATMP50440 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATMP50440 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATMP50440 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATMP50440 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATMP50440 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GATMP50440 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GATMP50440 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GATMP50440 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GATMP50440 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GATMP50440 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GATMP50440 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GATMP50440 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GATMP50440 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GATMP50440 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GATMP50440 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GATMP50440 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GATMP50440 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GATMP50440 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GATMP50440 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GATMP50440 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GATMP50440 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GATMP50440 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GATMP50440 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GATMP50440 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GATMP50440 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GATMP50440 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GATMP50440 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GATMP50440 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GATMP50440 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GATMP50440 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GATMP50440 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GATMP50440 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GATMP50440 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GATMP50440 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATMP50440 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATMP50440 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATMP50440 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATMP50440 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATMP50440 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATMP50440 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATMP50440 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATMP50440 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATMP50440 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GATMP50440 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATMP50440 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GATMP50440 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATMP50440 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATMP50440 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATMP50440 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATMP50440 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATMP50440 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATMP50440 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATMP50440 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATMP50440 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATMP50440 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATMP50440 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATMP50440 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATMP50440 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATMP50440 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATMP50440 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATMP50440 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GATMP50440 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATMP50440 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATMP50440 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATMP50440 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATMP50440 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATMP50440 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATMP50440 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATMP50440 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATMP50440 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATMP50440 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATMP50440 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATMP50440 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATMP50440 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATMP50440 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATMP50440 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GATMP50440 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATMP50440 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATMP50440 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATMP50440 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATMP50440 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATMP50440 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATMP50440 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms