Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRIM1P49642 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms