Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTPAP49638 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTPAP49638 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTPAP49638 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTPAP49638 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTPAP49638 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTPAP49638 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTPAP49638 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTPAP49638 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTPAP49638 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTPAP49638 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTPAP49638 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTPAP49638 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTPAP49638 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTPAP49638 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TTPAP49638 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TTPAP49638 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTPAP49638 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTPAP49638 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTPAP49638 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTPAP49638 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTPAP49638 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTPAP49638 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TTPAP49638 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTPAP49638 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTPAP49638 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTPAP49638 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTPAP49638 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTPAP49638 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTPAP49638 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTPAP49638 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTPAP49638 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTPAP49638 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TTPAP49638 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTPAP49638 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTPAP49638 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTPAP49638 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTPAP49638 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
TTPAP49638 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTPAP49638 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTPAP49638 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTPAP49638 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTPAP49638 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTPAP49638 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTPAP49638 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTPAP49638 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTPAP49638 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTPAP49638 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTPAP49638 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTPAP49638 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTPAP49638 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTPAP49638 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTPAP49638 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTPAP49638 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTPAP49638 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTPAP49638 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTPAP49638 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTPAP49638 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTPAP49638 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTPAP49638 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTPAP49638 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TTPAP49638 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TTPAP49638 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTPAP49638 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTPAP49638 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTPAP49638 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTPAP49638 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTPAP49638 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTPAP49638 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTPAP49638 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTPAP49638 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTPAP49638 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTPAP49638 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTPAP49638 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTPAP49638 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTPAP49638 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTPAP49638 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTPAP49638 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTPAP49638 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTPAP49638 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTPAP49638 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTPAP49638 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTPAP49638 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TTPAP49638 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTPAP49638 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TTPAP49638 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTPAP49638 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTPAP49638 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTPAP49638 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTPAP49638 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTPAP49638 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTPAP49638 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTPAP49638 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTPAP49638 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTPAP49638 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTPAP49638 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTPAP49638 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTPAP49638 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTPAP49638 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTPAP49638 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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