Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA4P43681 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms