Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACTR1BP42025 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTR1BP42025 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms