Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPHP41219 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPHP41219 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPHP41219 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPHP41219 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPHP41219 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPHP41219 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPHP41219 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPHP41219 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPHP41219 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPHP41219 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPHP41219 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPHP41219 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPHP41219 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPHP41219 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPHP41219 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPHP41219 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPHP41219 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPHP41219 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPHP41219 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPHP41219 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPHP41219 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPHP41219 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPHP41219 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPHP41219 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPHP41219 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPHP41219 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPHP41219 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPHP41219 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPHP41219 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPHP41219 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPHP41219 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPHP41219 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPHP41219 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPHP41219 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPHP41219 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPHP41219 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPHP41219 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPHP41219 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPHP41219 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPHP41219 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPHP41219 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPHP41219 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPHP41219 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPHP41219 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPHP41219 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPHP41219 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPHP41219 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPHP41219 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPHP41219 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPHP41219 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPHP41219 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPHP41219 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPHP41219 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPHP41219 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPHP41219 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPHP41219 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPHP41219 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPHP41219 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPHP41219 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPHP41219 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPHP41219 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPHP41219 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPHP41219 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPHP41219 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPHP41219 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPHP41219 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPHP41219 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPHP41219 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPHP41219 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPHP41219 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPHP41219 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPHP41219 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPHP41219 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPHP41219 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPHP41219 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPHP41219 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPHP41219 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPHP41219 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPHP41219 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPHP41219 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPHP41219 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPHP41219 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPHP41219 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPHP41219 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPHP41219 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPHP41219 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPHP41219 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPHP41219 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPHP41219 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPHP41219 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPHP41219 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPHP41219 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPHP41219 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPHP41219 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPHP41219 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPHP41219 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPHP41219 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPHP41219 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPHP41219 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms