Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2IP36954 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms