Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP7BP35670 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP7BP35670 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP7BP35670 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP7BP35670 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP7BP35670 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP7BP35670 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP7BP35670 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP7BP35670 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP7BP35670 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP7BP35670 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP7BP35670 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP7BP35670 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP7BP35670 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP7BP35670 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP7BP35670 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP7BP35670 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP7BP35670 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP7BP35670 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP7BP35670 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP7BP35670 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP7BP35670 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP7BP35670 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP7BP35670 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP7BP35670 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP7BP35670 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP7BP35670 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP7BP35670 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATP7BP35670 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATP7BP35670 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP7BP35670 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms