Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT9P35527 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT9P35527 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT9P35527 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT9P35527 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT9P35527 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT9P35527 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT9P35527 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT9P35527 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT9P35527 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT9P35527 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT9P35527 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT9P35527 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT9P35527 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT9P35527 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT9P35527 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT9P35527 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT9P35527 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT9P35527 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT9P35527 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT9P35527 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT9P35527 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT9P35527 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT9P35527 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT9P35527 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT9P35527 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT9P35527 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT9P35527 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT9P35527 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT9P35527 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT9P35527 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT9P35527 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT9P35527 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT9P35527 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT9P35527 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT9P35527 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT9P35527 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT9P35527 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT9P35527 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT9P35527 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT9P35527 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT9P35527 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT9P35527 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT9P35527 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT9P35527 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT9P35527 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT9P35527 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT9P35527 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT9P35527 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT9P35527 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT9P35527 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT9P35527 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT9P35527 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT9P35527 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT9P35527 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT9P35527 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT9P35527 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT9P35527 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT9P35527 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT9P35527 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT9P35527 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT9P35527 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT9P35527 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT9P35527 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT9P35527 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT9P35527 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT9P35527 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT9P35527 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT9P35527 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT9P35527 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT9P35527 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT9P35527 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT9P35527 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT9P35527 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT9P35527 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT9P35527 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT9P35527 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT9P35527 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT9P35527 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT9P35527 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT9P35527 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT9P35527 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT9P35527 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT9P35527 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT9P35527 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT9P35527 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT9P35527 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT9P35527 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT9P35527 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT9P35527 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT9P35527 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT9P35527 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT9P35527 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT9P35527 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT9P35527 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT9P35527 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT9P35527 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT9P35527 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT9P35527 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT9P35527 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms