Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 SUPT5H-201ENST00000359191 3770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.22e-9■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 SUPT5H-203ENST00000402194 3698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.212e-9■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 SUPT5H-213ENST00000598725 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.332e-9■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 SUPT5H-215ENST00000599117 3902 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.372e-9■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 SUPT5H-204ENST00000432763 3710 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.52e-9■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.451e-6■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 SLC25A37-203ENST00000517923 573 ntTSL 414.41□□□□□ -0.17e-20■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 SLC25A37-208ENST00000520949 548 ntTSL 411.42□□□□□ -0.587e-20■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 SLC25A37-207ENST00000520654 3018 ntTSL 1 (best)10.03□□□□□ -0.87e-20■■■■■ 29.8
GTF2F1P35269 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.511e-7■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.321e-7■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 SLC2A9-208ENST00000506583 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.11e-7■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 C20orf24-205ENST00000491113 734 ntTSL 228.32■■■□□ 2.124e-8■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.964e-8■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.934e-8■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.934e-8■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 C20orf24-206ENST00000492721 1044 ntTSL 224.69■■□□□ 1.544e-8■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 C20orf24-204ENST00000483815 1170 ntTSL 1 (best)20.58■□□□□ 0.894e-8■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.814e-8■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.754e-8■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 MFSD12-207ENST00000588626 525 ntTSL 319.55■□□□□ 0.724e-8■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 MFSD12-206ENST00000586402 476 ntTSL 319.17■□□□□ 0.664e-8■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 MFSD12-212ENST00000591878 557 ntTSL 518.02■□□□□ 0.484e-8■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.434e-8■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.344e-8■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 MFSD12-205ENST00000585814 1002 ntTSL 317.13■□□□□ 0.334e-8■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 MFSD12-213ENST00000592652 486 ntTSL 515.45■□□□□ 0.064e-8■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.014e-8■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 C20orf24-207ENST00000494506 874 ntTSL 28.69□□□□□ -1.024e-8■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.784e-8■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 PHF23-210ENST00000574407 497 ntTSL 223.42■■□□□ 1.345e-8■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 PHF23-209ENST00000574323 575 ntTSL 415.45■□□□□ 0.065e-8■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 SLC4A2-216ENST00000490898 702 ntTSL 318.21■□□□□ 0.517e-7■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.498e-7■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.138e-7■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.088e-7■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 MBOAT7-206ENST00000437868 2033 ntTSL 1 (best)24.39■■□□□ 1.498e-7■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.432e-7■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.392e-7■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 RALGDS-213ENST00000493438 4602 ntTSL 217.34■□□□□ 0.372e-7■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 RALGDS-203ENST00000372062 3596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.012e-7■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 RALGDS-204ENST00000393157 3689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.562e-7■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 LINC01234-205ENST00000551982 700 ntTSL 513.58□□□□□ -0.242e-6■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 LINC01234-201ENST00000510694 1467 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 LINC01234-202ENST00000547963 2088 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.712e-6■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.382e-6■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 LINC01234-203ENST00000550223 1075 ntTSL 25.99□□□□□ -1.452e-6■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.14e-7■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 NXN-206ENST00000571684 1159 ntTSL 321■□□□□ 0.954e-7■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.624e-7■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.43e-7■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.233e-7■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.213e-7■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.062e-7■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.922e-7■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.742e-7■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.782e-8■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 WDR6-216ENST00000489684 1155 ntTSL 217.78■□□□□ 0.442e-8■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 WDR6-211ENST00000471162 3565 ntTSL 1 (best)15.34■□□□□ 0.052e-8■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.012e-8■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 WDR6-204ENST00000420783 3656 ntTSL 1 (best)14.41□□□□□ -0.12e-8■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 WDR6-207ENST00000448293 3377 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.232e-8■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 WDR6-220ENST00000608424 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.282e-8■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 WDR6-208ENST00000452875 3916 ntTSL 1 (best)13.18□□□□□ -0.32e-8■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 WDR6-221ENST00000610967 4259 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.412e-8■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.421e-7■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 SUMO1-208ENST00000409627 722 ntTSL 317.65■□□□□ 0.421e-7■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.421e-7■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.141e-7■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.131e-7■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.131e-7■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.131e-7■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 SUMO1-202ENST00000392245 1071 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.171e-7■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.341e-7■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 PUS1-210ENST00000544213 687 ntTSL 526.26■■□□□ 1.794e-12■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.926e-7■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.796e-7■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.316e-7■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 COQ8A-205ENST00000478406 3612 ntTSL 216.84■□□□□ 0.296e-7■■■■■ 29.7
GTF2F1P35269 USP32-208ENST00000589335 691 ntTSL 522.02■■□□□ 1.125e-11■■■■■ 29.6
GTF2F1P35269 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.925e-11■■■■■ 29.6
GTF2F1P35269 USP32-207ENST00000588898 578 ntTSL 513.63□□□□□ -0.235e-11■■■■■ 29.6
GTF2F1P35269 USP32-211ENST00000590133 2563 ntTSL 210.86□□□□□ -0.675e-11■■■■■ 29.6
GTF2F1P35269 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 29.6
GTF2F1P35269 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.124e-7■■■■■ 29.6
GTF2F1P35269 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 29.6
GTF2F1P35269 TMEM164-208ENST00000497754 236 ntTSL 224.63■■□□□ 1.531e-7■■■■■ 29.6
GTF2F1P35269 TMEM164-207ENST00000471255 418 ntTSL 319.95■□□□□ 0.781e-7■■■■■ 29.6
GTF2F1P35269 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.051e-7■■■■■ 29.6
GTF2F1P35269 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.094e-7■■■■■ 29.6
GTF2F1P35269 SYNGAP1-206ENST00000479510 2073 ntTSL 228.98■■■□□ 2.232e-6■■■■■ 29.6
GTF2F1P35269 SYNGAP1-227ENST00000638142 2499 ntTSL 523.87■■□□□ 1.412e-6■■■■■ 29.6
GTF2F1P35269 SYNGAP1-207ENST00000628646 4264 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 29.6
GTF2F1P35269 GNB1-204ENST00000439272 602 ntTSL 510.34□□□□□ -0.752e-9■■■■■ 29.6
GTF2F1P35269 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.731e-6■■■■■ 29.6
GTF2F1P35269 MGMT-204ENST00000482653 589 ntTSL 39.71□□□□□ -0.862e-10■■■■■ 29.6
GTF2F1P35269 HPN-207ENST00000599363 1828 ntTSL 524.65■■□□□ 1.542e-8■■■■■ 29.6
GTF2F1P35269 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.632e-8■■■■■ 29.6
GTF2F1P35269 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.492e-8■■■■■ 29.6
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 177.2 ms