Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTX2P32243 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTX2P32243 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTX2P32243 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTX2P32243 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTX2P32243 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTX2P32243 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTX2P32243 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTX2P32243 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTX2P32243 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTX2P32243 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTX2P32243 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTX2P32243 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTX2P32243 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTX2P32243 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTX2P32243 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTX2P32243 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTX2P32243 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTX2P32243 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTX2P32243 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTX2P32243 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTX2P32243 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTX2P32243 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTX2P32243 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTX2P32243 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OTX2P32243 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OTX2P32243 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
OTX2P32243 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OTX2P32243 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OTX2P32243 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OTX2P32243 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OTX2P32243 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OTX2P32243 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
OTX2P32243 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OTX2P32243 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OTX2P32243 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OTX2P32243 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
OTX2P32243 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OTX2P32243 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OTX2P32243 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OTX2P32243 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
OTX2P32243 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
OTX2P32243 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
OTX2P32243 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
OTX2P32243 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
OTX2P32243 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
OTX2P32243 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OTX2P32243 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
OTX2P32243 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
OTX2P32243 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
OTX2P32243 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OTX2P32243 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
OTX2P32243 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OTX2P32243 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
OTX2P32243 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OTX2P32243 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OTX2P32243 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OTX2P32243 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
OTX2P32243 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OTX2P32243 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
OTX2P32243 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OTX2P32243 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
OTX2P32243 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
OTX2P32243 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
OTX2P32243 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
OTX2P32243 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
OTX2P32243 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
OTX2P32243 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
OTX2P32243 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
OTX2P32243 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
OTX2P32243 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
OTX2P32243 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
OTX2P32243 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
OTX2P32243 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
OTX2P32243 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
OTX2P32243 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
OTX2P32243 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OTX2P32243 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OTX2P32243 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OTX2P32243 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OTX2P32243 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
OTX2P32243 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OTX2P32243 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
OTX2P32243 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OTX2P32243 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OTX2P32243 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OTX2P32243 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OTX2P32243 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
OTX2P32243 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
OTX2P32243 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OTX2P32243 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
OTX2P32243 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
OTX2P32243 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
OTX2P32243 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
OTX2P32243 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
OTX2P32243 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
OTX2P32243 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
OTX2P32243 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
OTX2P32243 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OTX2P32243 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms