Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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CASQ1P31415 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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CASQ1P31415 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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CASQ1P31415 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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CASQ1P31415 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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CASQ1P31415 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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CASQ1P31415 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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CASQ1P31415 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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CASQ1P31415 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASQ1P31415 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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CASQ1P31415 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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CASQ1P31415 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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CASQ1P31415 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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