Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNA5P30532 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNA5P30532 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNA5P30532 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNA5P30532 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNA5P30532 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNA5P30532 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNA5P30532 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNA5P30532 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNA5P30532 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNA5P30532 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNA5P30532 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNA5P30532 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNA5P30532 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNA5P30532 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNA5P30532 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNA5P30532 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNA5P30532 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNA5P30532 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNA5P30532 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNA5P30532 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms