Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCKSP29966 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms