Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PSMA1P25786 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMA1P25786 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms