Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKCHP24723 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRKCHP24723 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRKCHP24723 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PRKCHP24723 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRKCHP24723 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKCHP24723 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKCHP24723 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKCHP24723 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKCHP24723 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKCHP24723 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKCHP24723 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKCHP24723 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKCHP24723 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKCHP24723 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKCHP24723 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRKCHP24723 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKCHP24723 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKCHP24723 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKCHP24723 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKCHP24723 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKCHP24723 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKCHP24723 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRKCHP24723 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKCHP24723 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRKCHP24723 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKCHP24723 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKCHP24723 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKCHP24723 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKCHP24723 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKCHP24723 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKCHP24723 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKCHP24723 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKCHP24723 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKCHP24723 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKCHP24723 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
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