Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5F1P24539 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms