Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCSHP23434 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCSHP23434 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCSHP23434 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCSHP23434 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCSHP23434 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCSHP23434 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCSHP23434 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GCSHP23434 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCSHP23434 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCSHP23434 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCSHP23434 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCSHP23434 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCSHP23434 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCSHP23434 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCSHP23434 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCSHP23434 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCSHP23434 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCSHP23434 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GCSHP23434 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCSHP23434 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCSHP23434 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GCSHP23434 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCSHP23434 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCSHP23434 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCSHP23434 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCSHP23434 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCSHP23434 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCSHP23434 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCSHP23434 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCSHP23434 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCSHP23434 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCSHP23434 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCSHP23434 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCSHP23434 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCSHP23434 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCSHP23434 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCSHP23434 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCSHP23434 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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GCSHP23434 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCSHP23434 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCSHP23434 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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GCSHP23434 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCSHP23434 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCSHP23434 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCSHP23434 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCSHP23434 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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GCSHP23434 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCSHP23434 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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GCSHP23434 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCSHP23434 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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GCSHP23434 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCSHP23434 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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GCSHP23434 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCSHP23434 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCSHP23434 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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GCSHP23434 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCSHP23434 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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GCSHP23434 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCSHP23434 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCSHP23434 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCSHP23434 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCSHP23434 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCSHP23434 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCSHP23434 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCSHP23434 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCSHP23434 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCSHP23434 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCSHP23434 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCSHP23434 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCSHP23434 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCSHP23434 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCSHP23434 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GCSHP23434 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GCSHP23434 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GCSHP23434 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GCSHP23434 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GCSHP23434 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GCSHP23434 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GCSHP23434 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GCSHP23434 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GCSHP23434 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GCSHP23434 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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