Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASTP20810 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CASTP20810 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASTP20810 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASTP20810 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASTP20810 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CASTP20810 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASTP20810 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASTP20810 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASTP20810 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASTP20810 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASTP20810 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASTP20810 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASTP20810 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASTP20810 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASTP20810 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASTP20810 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASTP20810 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASTP20810 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASTP20810 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASTP20810 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASTP20810 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASTP20810 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASTP20810 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASTP20810 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASTP20810 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASTP20810 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASTP20810 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASTP20810 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CASTP20810 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASTP20810 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASTP20810 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASTP20810 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASTP20810 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASTP20810 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASTP20810 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASTP20810 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASTP20810 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASTP20810 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASTP20810 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASTP20810 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASTP20810 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASTP20810 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CASTP20810 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASTP20810 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASTP20810 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASTP20810 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASTP20810 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASTP20810 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASTP20810 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASTP20810 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CASTP20810 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASTP20810 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASTP20810 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASTP20810 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASTP20810 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASTP20810 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASTP20810 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASTP20810 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASTP20810 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASTP20810 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASTP20810 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASTP20810 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASTP20810 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASTP20810 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASTP20810 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASTP20810 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASTP20810 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASTP20810 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASTP20810 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASTP20810 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASTP20810 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASTP20810 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASTP20810 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASTP20810 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASTP20810 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASTP20810 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASTP20810 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASTP20810 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASTP20810 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASTP20810 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASTP20810 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASTP20810 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASTP20810 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASTP20810 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASTP20810 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CASTP20810 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASTP20810 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASTP20810 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASTP20810 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASTP20810 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASTP20810 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASTP20810 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASTP20810 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASTP20810 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASTP20810 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASTP20810 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASTP20810 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASTP20810 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASTP20810 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms