Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB5AP20339 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB5AP20339 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB5AP20339 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB5AP20339 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB5AP20339 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB5AP20339 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB5AP20339 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB5AP20339 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB5AP20339 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB5AP20339 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB5AP20339 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB5AP20339 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB5AP20339 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB5AP20339 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB5AP20339 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5AP20339 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5AP20339 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5AP20339 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5AP20339 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5AP20339 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5AP20339 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5AP20339 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms