Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9A1P19634 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms