Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ITGB4P16144 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGB4P16144 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms