Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RLBP1P12271 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RLBP1P12271 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms