Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VPREB1P12018 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms