Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2P10911 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2P10911 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2P10911 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2P10911 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2P10911 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2P10911 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2P10911 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2P10911 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2P10911 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2P10911 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2P10911 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2P10911 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2P10911 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2P10911 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2P10911 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2P10911 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2P10911 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2P10911 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2P10911 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2P10911 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2P10911 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2P10911 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2P10911 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2P10911 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2P10911 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2P10911 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCF2P10911 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MCF2P10911 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCF2P10911 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCF2P10911 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCF2P10911 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCF2P10911 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCF2P10911 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCF2P10911 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCF2P10911 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCF2P10911 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCF2P10911 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCF2P10911 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCF2P10911 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCF2P10911 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCF2P10911 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MCF2P10911 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCF2P10911 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCF2P10911 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCF2P10911 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCF2P10911 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCF2P10911 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCF2P10911 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCF2P10911 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCF2P10911 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCF2P10911 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCF2P10911 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCF2P10911 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCF2P10911 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCF2P10911 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCF2P10911 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCF2P10911 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCF2P10911 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCF2P10911 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCF2P10911 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCF2P10911 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCF2P10911 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCF2P10911 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCF2P10911 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCF2P10911 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCF2P10911 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCF2P10911 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MCF2P10911 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCF2P10911 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCF2P10911 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCF2P10911 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MCF2P10911 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCF2P10911 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCF2P10911 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCF2P10911 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCF2P10911 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCF2P10911 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCF2P10911 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCF2P10911 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCF2P10911 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MCF2P10911 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCF2P10911 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCF2P10911 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCF2P10911 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCF2P10911 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCF2P10911 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCF2P10911 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCF2P10911 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCF2P10911 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCF2P10911 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCF2P10911 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCF2P10911 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCF2P10911 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCF2P10911 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCF2P10911 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCF2P10911 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCF2P10911 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCF2P10911 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCF2P10911 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms