Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGPD2P0DJD1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD2P0DJD1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms