Protein–RNA interactions for Protein: P0CF51

TRGC1, T-cell receptor gamma chain C region 1, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRGC1P0CF51 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRGC1P0CF51 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms