Protein–RNA interactions for Protein: P09630

HOXC6, Homeobox protein Hox-C6, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6P09630 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXC6P09630 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms