Protein–RNA interactions for Protein: P09341

CXCL1, Growth-regulated alpha protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL1P09341 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL1P09341 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL1P09341 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms