Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRCP08575 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRCP08575 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
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