Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SRPRAP08240 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRPRAP08240 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms