Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F13BP05160 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
F13BP05160 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
F13BP05160 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F13BP05160 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F13BP05160 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F13BP05160 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F13BP05160 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F13BP05160 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F13BP05160 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
F13BP05160 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
F13BP05160 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
F13BP05160 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
F13BP05160 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F13BP05160 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
F13BP05160 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
F13BP05160 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
F13BP05160 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F13BP05160 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
F13BP05160 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F13BP05160 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F13BP05160 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
F13BP05160 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F13BP05160 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F13BP05160 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
F13BP05160 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
F13BP05160 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
F13BP05160 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
F13BP05160 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
F13BP05160 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
F13BP05160 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
F13BP05160 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
F13BP05160 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
F13BP05160 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
F13BP05160 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
F13BP05160 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
F13BP05160 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
F13BP05160 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F13BP05160 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
F13BP05160 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F13BP05160 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
F13BP05160 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F13BP05160 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F13BP05160 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F13BP05160 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F13BP05160 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
F13BP05160 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F13BP05160 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F13BP05160 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F13BP05160 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
F13BP05160 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
F13BP05160 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F13BP05160 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F13BP05160 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F13BP05160 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F13BP05160 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
F13BP05160 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
F13BP05160 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F13BP05160 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F13BP05160 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
F13BP05160 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
F13BP05160 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F13BP05160 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F13BP05160 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F13BP05160 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F13BP05160 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F13BP05160 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F13BP05160 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
F13BP05160 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
F13BP05160 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
F13BP05160 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
F13BP05160 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
F13BP05160 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
F13BP05160 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
F13BP05160 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
F13BP05160 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
F13BP05160 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
F13BP05160 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
F13BP05160 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
F13BP05160 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
F13BP05160 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
F13BP05160 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
F13BP05160 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
F13BP05160 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
F13BP05160 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
F13BP05160 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
F13BP05160 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
F13BP05160 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
F13BP05160 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
F13BP05160 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
F13BP05160 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
F13BP05160 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
F13BP05160 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
F13BP05160 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
F13BP05160 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
F13BP05160 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
F13BP05160 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
F13BP05160 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
F13BP05160 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
F13BP05160 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms