Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB4AP04350 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB4AP04350 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms