Protein–RNA interactions for Protein: P02675

FGB, Fibrinogen beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGBP02675 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGBP02675 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGBP02675 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGBP02675 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGBP02675 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGBP02675 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGBP02675 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGBP02675 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGBP02675 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGBP02675 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGBP02675 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGBP02675 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGBP02675 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGBP02675 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FGBP02675 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FGBP02675 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGBP02675 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGBP02675 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGBP02675 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGBP02675 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGBP02675 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGBP02675 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FGBP02675 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FGBP02675 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGBP02675 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGBP02675 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGBP02675 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGBP02675 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGBP02675 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGBP02675 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGBP02675 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FGBP02675 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGBP02675 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGBP02675 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FGBP02675 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGBP02675 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGBP02675 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGBP02675 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGBP02675 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGBP02675 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGBP02675 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGBP02675 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGBP02675 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGBP02675 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGBP02675 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGBP02675 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FGBP02675 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGBP02675 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGBP02675 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGBP02675 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGBP02675 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGBP02675 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FGBP02675 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGBP02675 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGBP02675 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGBP02675 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGBP02675 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGBP02675 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGBP02675 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGBP02675 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGBP02675 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGBP02675 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGBP02675 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGBP02675 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGBP02675 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGBP02675 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGBP02675 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FGBP02675 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGBP02675 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGBP02675 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGBP02675 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGBP02675 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGBP02675 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGBP02675 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGBP02675 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGBP02675 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGBP02675 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGBP02675 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGBP02675 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGBP02675 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGBP02675 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGBP02675 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGBP02675 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGBP02675 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGBP02675 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FGBP02675 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGBP02675 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGBP02675 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGBP02675 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FGBP02675 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FGBP02675 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FGBP02675 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGBP02675 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGBP02675 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGBP02675 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGBP02675 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGBP02675 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGBP02675 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGBP02675 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGBP02675 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms